Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapaQ9WV55 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapaQ9WV55 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms