Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnip1Q9WUU8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnip1Q9WUU8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms