Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srd5a3Q9WUP4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms