Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13bQ9WU72 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms