Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nrf1Q9WU00 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nrf1Q9WU00 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms