Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PplQ9R269 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PplQ9R269 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms