Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf103Q9R1W3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms