Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim3Q9R1R2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms