Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg1Q9R0Y8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms