Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed2Q9R0Q3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed2Q9R0Q3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms