Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zeb2Q9R0G7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zeb2Q9R0G7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms