Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod1Q9R0E2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms