Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr54Q9R0D8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms