Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Plod2Q9R0B9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Plod2Q9R0B9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms