Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nubp2Q9R061 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nubp2Q9R061 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nubp2Q9R061 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms