Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtsjQ9R014 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms