Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col4a3Q9QZS0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col4a3Q9QZS0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms