Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp21Q9QZL6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp21Q9QZL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Usp21Q9QZL6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp21Q9QZL6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms