Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmlQ9QZD5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChmlQ9QZD5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms