Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh11Q9QYF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh11Q9QYF1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms