Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Opn4Q9QXZ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn4Q9QXZ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms