Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nufip1Q9QXX8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms