Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf354bQ9QXT9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf354bQ9QXT9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf354bQ9QXT9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Znf354bQ9QXT9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms