Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PolkQ9QUG2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PolkQ9QUG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms