Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkain4Q9JMG4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkain4Q9JMG4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms