Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gkap1Q9JMB0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gkap1Q9JMB0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms