Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prg4Q9JM99 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg4Q9JM99 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms