Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arl6ip4Q9JM93 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip4Q9JM93 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms