Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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