Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Col5a3Q9JLI2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col5a3Q9JLI2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Col5a3Q9JLI2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col5a3Q9JLI2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms