Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgm1Q9JLF6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Tgm1Q9JLF6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Tgm1Q9JLF6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Tgm1Q9JLF6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tgm1Q9JLF6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgm1Q9JLF6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms