Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nectin3Q9JLB9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nectin3Q9JLB9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms