Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chrac1Q9JKP8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms