Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pole3Q9JKP7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms