Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nova1Q9JKN6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nova1Q9JKN6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms