Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cyp39a1Q9JKJ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms