Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trem3Q9JKE1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms