Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ybx3Q9JKB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ybx3Q9JKB3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms