Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uchl3Q9JKB1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms