Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms