Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnga3Q9JJZ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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