Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tuba8Q9JJZ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms