Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gfra4Q9JJT2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfra4Q9JJT2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms