Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bco1Q9JJS6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms