Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efcc1Q9JJF6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Efcc1Q9JJF6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms