Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Riox1Q9JJF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms