Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF2

Spag4, Sperm-associated antigen 4 protein, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag4Q9JJF2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spag4Q9JJF2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Spag4Q9JJF2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Spag4Q9JJF2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms