Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Yipf7Q9JIM5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms