Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ercc6l2Q9JIM3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms