Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc22Q9JIG7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc22Q9JIG7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms